پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 49 |
| تعداد شماره‌ها | 1,327 |
| تعداد مقالات | 11,485 |
| تعداد مشاهده مقاله | 24,700,739 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,498,648 |
Density Functional Theory Investigation of Some Uridine Derivatives with Anti-Alzheimer Potential | ||
| Iranian Journal of Analytical Chemistry | ||
| دوره 13، شماره 1 - شماره پیاپی 25، خرداد 2026، صفحه 1-12 اصل مقاله (476.92 K) | ||
| نوع مقاله: Full research article | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.30473/ijac.2026.79066.1353 | ||
| نویسندگان | ||
| Marjan Rafiee* 1؛ Masoumeh Javaheri2 | ||
| 11Department of Chemistry, Payame Noor University, P. O. Box: 19395-3697, Tehran, Iran | ||
| 2Department of Ceramics, Materials and Energy Research Center, P.O. Box 14155/4777, Tehran, Iran, | ||
| چکیده | ||
| Uridine is an important nucleoside involved in RNA biosynthesis and phospholipid metabolism in the brain. In the present study, uridine and several of its derivatives were theoretically investigated as potential inhibitors of Alzheimer's disease. The electron charge density at eight sensitive sites, including hydrogen acceptor atoms (N1, O4, O5, and O6) and hydrogen donor atoms (O1, O2, O3, and N2), was examined through the calculation and comparison of electric field gradients (EFGs) and nuclear quadrupole coupling constants (NQCCs). The results indicate that the presence of a phosphate group in compound 3 increases the electron density at the O1 atom compared with the other studied compounds. This finding is further supported by Natural Bond Orbital (NBO) analysis. The obtained results suggest that O1 may act as the most active site in these compounds, and its electron density appears to be directly related to their biological activity. Therefore, any structural modification or substitution that increases the electron density at this atom may contribute to the development of more effective therapeutic agents for Alzheimer's disease. All calculations were performed using Density Functional Theory (DFT) at the B3LYP/6-31G* level of theory. The HOMO–LUMO and molecular docking analyses consistently highlighted compound 3 as the most promising derivative among the investigated compounds, exhibiting favorable electronic characteristics and the strongest predicted binding affinity toward AChE. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Uridine؛ Uridine monophosphate؛ Alzheimer؛ NQCCs؛ NBO | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| مطالعه برخی مشتقات اوریدین با پتانسیل ضد آلزایمر با استفاده از نظریه تابعی چگالی | ||
| چکیده [English] | ||
| اوریدین یکی از نوکلئوتیدهای مهم زیستی است که در بیوسنتز RNA و متابولیسم فسفولیپیدها نقش دارد و به دلیل ارتباط بالقوه آن با عملکرد سیستم عصبی و بیماری آلزایمر مورد توجه قرار گرفته است. در این پژوهش، اوریدین و دو مشتق آن به‌منظور بررسی ویژگی‌های الکترونی و توزیع چگالی بار با استفاده از نظریه تابعی چگالی (DFT) در سطح B3LYP/6-31G* مورد مطالعه نظری قرار گرفتند. چگالی الکترونی در هشت جایگاه حساس مولکولی، شامل اتم‌های گیرنده پیوند هیدروژنی N1)، O4، O5 و (O6 و اتم‌های دهنده پیوند هیدروژنی O1)، O2، O3 و (N2، از طریق محاسبه و مقایسه گرادیان میدان الکتریکی (EFG) و ثابت‌های جفت‌شدگی چهارقطبی هسته‌ای (NQCC) ارزیابی شد. نتایج نشان داد که تغییرات چگالی الکترونی در بیشتر اتم‌های مورد بررسی نسبتاً ناچیز است. بااین‌حال، حضور گروه فسفات در ترکیب 3 موجب کاهش مقدار NQCC اتم O1 و در نتیجه افزایش چگالی الکترونی در این جایگاه شد. تحلیل اوربیتال طبیعی پیوندی (NBO) نیز این یافته را تأیید کرد و وجود برهم‌کنش‌های اضافی دهنده–گیرنده مرتبط با O1 و گروه فسفات را نشان داد که موجب افزایش دلوکالیزاسیون الکترونی و انتقال چگالی بار به این ناحیه می‌شوند. تطابق مناسب نتایج NQCC و NBO نشان داد که O1 حساس‌ترین و فعال‌ترین جایگاه الکترونی در مشتقات مورد مطالعه است. همچنین، تحلیل‌های HOMO–LUMO و داکینگ مولکولی، به‌طور همسو، ترکیب 3 را به‌عنوان امیدبخش‌ترین مشتق در میان ترکیبات مورد بررسی شناسایی کردند که دارای ویژگی‌های الکترونی مطلوب و قوی‌ترین میل اتصال پیش‌بینی‌شده به آنزیم استیل‌کولین‌استراز (AChE) بود. این یافته‌ها نشان می‌دهد که افزایش چگالی الکترونی در اتم O1 می‌تواند در طراحی مشتقات جدید اوریدین با ویژگی‌های زیستی مطلوب‌تر مورد توجه قرار گیرد و اطلاعات نظری ارزشمندی برای توسعه ترکیبات دارای فعالیت بالقوه ضد آلزایمر فراهم کند. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| اوریدین, اوریدین مونوفسفات, بیماری آلزایمر, ثابت‌های جفت‌شدگی چهارقطبی هسته‌ای, تحلیل اوربیتال طبیعی پیوندی (NBO) | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 6 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 5 |
||