پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 49 |
| تعداد شماره‌ها | 1,331 |
| تعداد مقالات | 11,478 |
| تعداد مشاهده مقاله | 24,838,124 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,614,465 |
شناسایی و تحلیل خانواده پپتیدهای کوچک RALF در ترانسکریپتوم برگ گیاه کلوس (Kelussia odoratissima Mozaff) | ||
| فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 25 مهر 1405 | ||
| نوع مقاله: علمی پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.30473/cb.2026.77725.2036 | ||
| نویسندگان | ||
| سعیده کریمی کلیشادی1؛ فرهاد نظریان فیروزآبادی* 2؛ سجاد سهرابی1؛ میترا خادمی3 | ||
| 1دانشگاه لرستان | ||
| 2دنشگاه لرستان | ||
| 3دانشگاه لرستان | ||
| چکیده | ||
| کلوس (Kelussia odoratissima Mozaff) گیاه دارویی، بومی و در معرض خطر انقراض با کاربردهای درمانی است. بررسی ترانسکریپتوم این گیاه برای یافتن ژن‌های کدکننده پپتیدهای مختلف، برای محافظت از این گونه وحشی و آسیب‌پذیر حیاتی است. پپتیدهای RALF (Rapid Alkalinization Factor) از جمله پپتیدهای کوچک، ترشحی و هورمونی در گیاهان هستند که نقش مهمی در تنظیم رشد، نمو و پاسخ به تنش‌های محیطی ایفا می‌کنند. در این پژوهش، با هدف شناسایی و تحلیل اعضای خانواده پپتیدهای RALF گیاه کلوس، از داده‌های ترانسکریپتوم برگ این گیاه به کمک روش‌های بیوانفورماتیکی استفاده شد. نتایج بررسی ترانسکریپتوم برگ این گیاه منجر به شناسایی ۹ ژن کدکننده پپتیدهای خانواده RALF گردید. در توالی این پپتیدها موتیف‌های حفاظت‌شده‌ای RRXL و YISY و نیز چهار اسید آمینه حفظ شده سیستئین شناسایی شد. نتایج بررسی ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی پپتیدهای این خانواده بیانگر تنوع قابل‌توجهی در طول، وزن مولکولی و نقطه ایزوالکتریک آنها بود. این طیف از تنوّع نشان می‌دهد که پپتیدهای این خانواده اگرچه از نظر عملکرد یکسان هستند، اما از نظر توالی متفاوت بوده و هسته‌ی ساختاری یا موتیف اصلی در آنها حفظ شده است. به علاوه، تحلیل فیلوژنتیکی پپتیدهای این خانواده نشان داد که پپتیدهای این خانواده، بیشترین قرابت تکاملی را با گونه‌های خانواده Apiaceae نظیر هویج، کرفس و گشنیز دارند. در مجموع، یافته‌های این پژوهش برای اولین بار نشان دادند که پپتیدهای این خانواده در گیاه کلوس بیان می‌شوند و با توجه به نقش آنها در مواجهه با شرایط محیطی و تنش‌های مختلف، می‌توان از آنها برای بهنژادی سایر گونه‌های گیاهی استفاده نمود. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| بیوانفورماتیک؛ پپتیدها؛ سیگنالینگ گیاهی؛ ضد میکروبی؛ کرفس کوهی | ||
| موضوعات | ||
| بیوانفورماتیک | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Identification and Analysis of the Small RALF Peptide Family in the Leaf Transcriptome of Kelussia odoratissima Mozaff. | ||
| نویسندگان [English] | ||
| saeideh karimi kelishadi1؛ sayed sohrabi1؛ m khademi3؛ | ||
| 1university of Lorestan | ||
| 3university of lorestan | ||
| چکیده [English] | ||
| Kelussia odoratissima Mozaff. is an endangered medicinal plant valued for its therapeutic uses. Mining transcriptome for genes encoding various functional peptides is crucial to protect the vulnerable wild species from over-harvesting. RALF (Rapid Alkalinization Factor) peptides are small, secreted, hormone-like peptides in plants that play a crucial role in regulating growth, development, and responses to environmental stresses. In this study, to identify and characterize members of the RALF peptide family in kelus, leaf transcriptome data was analyzed using bioinformatics approaches. Analysis resulted in the identification of 9 genes encoding peptides of the RALF family. Sequence analysis these peptides revealed that they possess conserved motifs such as RRXL and YISY, as well as four conserved cysteine residues. Further investigations showed that changes in length, net charge, and amino acid composition of these peptides likely occurred during evolution and post-translational modifications, enabling their biological roles to adapt to environmental stresses through sequence variations. Additionally, phylogenetic analysis of the RALF peptides from Kelussia odoratissima revealed the closest evolutionary affinity to those from Apiaceae family including carrot, celery and coriander, indicating the conservation of these peptides' functions across higher plants. Overall, the findings of this study, for the first time, demonstrate that RALF family peptides are expressed in Kelussia odoratissima. Given their roles in coping with various environmental conditions and stresses, these peptides hold potential for use in the genetic improvement of other plant species. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Antimicrobial, Bioinformatics, Kelussia odoratissima Mozaff, Peptides, Plant signaling | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1 |
||