اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات41
تعداد شماره‌ها1,184
تعداد مقالات10,192
تعداد مشاهده مقاله19,149,009
تعداد دریافت فایل اصل مقاله13,260,125
نعمتی, نرگس, فلاح زیارانی, معصومه. (1404). آنالیز in silico ژن چالکون سنتتاز (CHS) در گیاه شاهدانه. فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی, 14(شماره 3 (بهار 1404)), 43-52. doi: 10.30473/cb.2025.73286.1997
نرگس نعمتی; معصومه فلاح زیارانی. "آنالیز in silico ژن چالکون سنتتاز (CHS) در گیاه شاهدانه". فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی, 14, شماره 3 (بهار 1404), 1404, 43-52. doi: 10.30473/cb.2025.73286.1997
نعمتی, نرگس, فلاح زیارانی, معصومه. (1404). 'آنالیز in silico ژن چالکون سنتتاز (CHS) در گیاه شاهدانه', فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی, 14(شماره 3 (بهار 1404)), pp. 43-52. doi: 10.30473/cb.2025.73286.1997
نعمتی, نرگس, فلاح زیارانی, معصومه. آنالیز in silico ژن چالکون سنتتاز (CHS) در گیاه شاهدانه. فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی, 1404; 14(شماره 3 (بهار 1404)): 43-52. doi: 10.30473/cb.2025.73286.1997

آنالیز in silico ژن چالکون سنتتاز (CHS) در گیاه شاهدانه

فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی
دوره 14، شماره 3 (بهار 1404) - شماره پیاپی 49، خرداد 1404، صفحه 43-52    اصل مقاله (1.83 M)
نوع مقاله: علمی پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.30473/cb.2025.73286.1997
نویسندگان
نرگس نعمتی1؛ معصومه فلاح زیارانی* 2
1کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی و ژنتیک مولکولی
2دکتری، دانشگاه شهید بهشتی تهران
چکیده
ژن چالکون سنتتاز(CHS) یکی از ژن های کلیدی در مسیر بیوسنتز فلاونوییدها در گیاهان است. این ژن کد کننده آنزیم چالکون سنتتاز می‌باشد که در مرحله ابتدایی مسیر بیوسنتز فلاونوییدها نقش مهمی دارد. ژن CHS علاوه بر نقش اصلی خود در بیوسنتز فلاونوییدها ممکن است در مسیرهای متابولیکی دیگری مانند تولید ترکیباتی که پیش ساز کانابینوییدها ( مانند THC و CBD) هستند نیز دخالت داشته باشند. به دلیل اهمیت این ژن در گیاه شاهدانه این ژن به کمک پایگاه‌های مختلف اطلاعاتی و نرم افزارهای گوناگون بیوانفورماتیک مطالعه گردید. جست و جوی توالی نوکلوتید شماره دسترسی NM_001397940 گیاه شاهدانه در پایگاه اطلاعاتی NCBI توانست 100 تطابق را نشان دهد. همردیفی توالی پروتیینی با شماره دسترسی NP_001384869.1 در گیاه شاهدانه مقابل پایگاه اطلاعاتی NCBI توانست 100 تطابق را نشان دهد. بیشترین امتیاز Max Score (805) متعلق به همردیفی با NP_001384869.1 از خود گیاه شاهدانه با 100% پوشش و 100% شباهات بود. کمترین Max Score (746) مربوط به همردیفی با QRV61377.1 از گونه Litchi chinensis با 99% پوشش و 92.01% شباهات بود. مقدار E-Value در این بخش نیز برای تشخیص معناداری تطابق ها مورد استفاده قرار گرفت. آنالیز فیلوژنتیکی 20 گونه اول که در آنالیز BLAST n با ژن CHS همولوژی نشان داده بود دندرومی ایجاد کرد که گونه‌های مورد مطالعه را در 6 گروه مجزا دسته‌بندی کرد. آنالیز تنوع ژنتیکی توسط نرم افزار MEGA 6 نشان داد که در حدود 31 درصد از طول توالی ژن CHS جهش‌‌‌های نوع جایگزینی رخ داده است.
کلیدواژه‌ها
ژن چالکون سنتتاز؛ تترا هیدروکانابینول؛ کانابیدیول؛ گیاه شاهدانه
موضوعات
بیوانفورماتیک
عنوان مقاله [English]
In Silico Analysis of Chalcone Synthetase (CHS) in Cannabis Sativa
نویسندگان [English]
narges nematiu1؛ masoumeh fallah ziarani2
1M.Sc. biotechnology and molecular genetic
2pHD, shahid beheshti university
چکیده [English]
The chalcone synthetase (CHS) gene is a key gene in the flavonoid biosynthesis pathway in plants. This gene encodes the enzyme chalcone synthase, which plays a crucial role in the early stages of the flavonoid biosynthesis pathway. In addition to its primary role in

flavonoid biosynthesis, the CHS gene may also be involved in other metabolic pathways, such as the production of compounds that are precursors to cannabinoids (like THC and CBD). Due to the importance of this gene in Cannabis sativa, it was studied using various bioinformatics databases and software tools.

A search of the nucleotide sequence of accession NM_001397940 from Cannabis sativa in the NCBI database revealed 100 matches. The highest Max Score (805) belonged to the alignment with NP_001384869.1 from the Cannabis plant itself, with 100% coverage and 100% similarity. The lowest Max Score (746) corresponded to the alignment with QRV61377.1 from the species Litchi Chinensis with 99% coverage and 92.01% similarity. The E-Value in this section was also used to determine the significance of the matches. Protein sequence alignment with accession number NP_001384869.1 from Cannabis sativa in the NCBI database also showed 100 matches. Phylogenetic analysis of the top 20 species that showed homology with the CHS gene in the BLAST n analysis created a dendrogram, classifying the species into six distinct groups. Genetic diversity analysis using MEGA 6 software indicated that approximately 31% of the CHS gene sequence has undergone substitution mutations and only 8% of these regions contain informative polymorphisms.
کلیدواژه‌ها [English]
Chalcone synthase gene, Tetrahydrocannabinol, Cannabidiol, Cannabis Sativa
مراجع
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 38
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 36


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب