پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 37 |
| تعداد شماره‌ها | 1,003 |
| تعداد مقالات | 8,559 |
| تعداد مشاهده مقاله | 15,338,920 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 10,734,234 |
تعیین تنوع ژنتیکی گونه بومی و نادر آبهای داخلی ایران، ماهی گورخری گنو Aphanius ginaonis با استفاده از مارکر مولکولی PCR-RFLP | ||
| فصلنامه علمی زیست شناسی جانوری تجربی | ||
| مقاله 3، دوره 6، شماره 4، خرداد 1397، صفحه 35-40 اصل مقاله (367.05 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| نویسندگان | ||
| عصمت سلیمی* 1؛ حسین ذوالقرنین2؛ بیتا ارچنگی3 | ||
| 1دانشگاه علوم و فنون دریایی | ||
| 2دکتری زیست دریا، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خوزستان | ||
| 3دکتری اکولوژی مولکولی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خوزستان | ||
| چکیده | ||
| چکیده کشور ایران با پراکندگی بسیار وسیع جغرافیایی دارای زیستگاههای متعدد و اهمیت بومشناسی بسیار بالایی می‌باشد. در میان مطالعات بومشناسی، بررسیهای انجامشده بر روی آبهای داخلی ایران بسیار اندک است. آگاهی از ویژگیهای زیستشناسی و همچنین بومشناسی گونههای مختلف آبزیان میتواند اطلاعات مفیدی جهت مدیریت مؤثر ذخایر ماهیان در آینده فراهم نماید. ماهی گورخری گنو (Aphanius ginaonis) گونه‌ای بومی ایران می‌باشد که منحصراً در چشمه آب گرم هرمزگان وجود دارد و در خطر انقراض می‌باشد. اهمیت این ماهی در مهار زیستی پشهها و ارزش زیبایی‌شناسی از نظر ماهیان زینتی و آکواریومی می‌باشد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت ماهی گورخری گنو با استفاده از روش PCR-RFLP بررسی گردید. جهت تعیین تنوع ژنتیکی این ماهی در حوضه خلیج فارس، تعداد 30 نمونه ماهی گورخری گنو از چشمه آب گرم گنو در استان هرمزگان جمع‌آوری گردید. جهت هضم آنزیمی محصول PCR به طول 550 جفت باز در ناحیه D-loop میتوکندریایی، از 5 آنزیم محدودگرAluI, DpnI, Eco47I, HindIII, HinfI استفاده شد. در نتیجه این آنالیزها، 9 هاپلوتیپ به دست آمد. 4 هاپلوتیپ به‌دست‌آمده در این ماهی جزء هاپلوتیپ‌های نادر بودند. هاپلوتیپ‌های EABAB، EACAB و CABAB بیشترین فراوانی را نشان دادند. تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی، تنوع بالایی را در این گونه نشان دادند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| واژه‌های کلیدی: Aphanius ginaonis؛ تنوع ژنتیکی؛ PCR-RFLP | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Determining the genetic diversity of mtDNA of endemic and rare species of Aphanius ginaonis in Iran internal waters by PCR-RFLP in D-loop region | ||
| نویسندگان [English] | ||
| esmat salimi1؛ Hosein Zolgharnine2؛ Bita Archangi3 | ||
| 1Former M. Sc. Student, Marine Ecology, Booshehr, Iran | ||
| 2Ph.D., Khorramshahr Marine Science and Technology University, Iran | ||
| 3Ph.D. of Molecular Ecology, Khorramshahr Marine Science and Technology University, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Abstract Iran with a vast geographical distribution has several habitats and a high ecological importance. Among the ecological studies done a few studies have been conducted on Iran's internal waters. Knowing the biological and ecological characteristics of different aquatic species in Iran can provide useful information for effective fish stock management in future. Aphanius ginaonis is an endangered species and have high ecological importance. In this study, Genetic diversity of Aphanius ginaonis was studied through PCR-RFLP method through mitochondrial DNA in D-loop region. To conduct this study, 30 Aphanius ginaonis from Geno hot spring in Hormozgan taken. The samples'DNA was extracted through phenol chloroform method. The length of PCR product was 550 bp. To digest PCR product, 5 restriction enzymes (AluI, DpnI, Eco47I, HindIII,HinfI) have been used. The data was analysed through Arlequin 3.11 software. 9 different haplotypes were revealed through analysis which four haplotypes were rare haplotype. Haplotypes EABAB, EACAB and CABAB showed the highest frequency. High haplotype and nucleotide diversity is resulted in this species. Results obtained from this research would be applicable to understand conservation genetics and management of this important fish species in Iran. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Keywords: Genetic Diversity, Aphanius ginaonis, PCR-RFLP | ||
| مراجع | ||
|
Khajeh, P.; (2010). Genetic polymorphism study of Aphanius ginaonis (Holly, 1929) using dicotian D-loop mitochondrial region. M. Sc. thesis. 89 pages.
Coad, B.W.; (1988). Aphanius vladykovi, a new species of tooth-carp from the Zagros Mountain of Iran (Osteichthyes: Cyprinidontidae). Environmental Biology of Fishes; 23: 115-125.
Cronin, M.A.; Hilis, S.; Born, E.W.; Potton, C.; (2001). mtDNA variation in Atlantic and Pacific walruses. 1994. Genetics; 3(72): 1035-1043.
Durna, S.; Bradkci, F.; Degerli, N.; (2010). Genetic diversity of Garra rufa Heckel, 1843 (Teleostei: Cyprinidae) in Anatolia. Biochemical Systematics and Ecology; 30: 83-92.
Eimanifar, A.; Rezvani, S.; Carapetian, J.; (2006). Genetic differentiation of Artemia urmiana from various ecological populations of Urmia Lake assessed by PCR amplified RFLP analysis. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology; 333: 275-285.
Esmaeili, H.R.; Ebrahimi, M.; Saifali, M.; (2008). Karyological analysis of five tooth-carps (Actinopterygii: Cyprinodontidae) from Iran. Micron; 39: 95-100.
Esmaeili, H.R.; Gholami, Z.; (2007). Investigation on the surface ultra-structure of scale of geno tooth-carp, Aphanius ginaonis (Holly,1929) (Actinopterygii: Cyprinodontidae) using scanning electron microscope. Iranian Journal of Biology; 20(2): 307-314.
Esmaeili, H.R.; Piravar, Z.; Shiva, A.H.; (2007). Karyological Analysis of Two Endemic Tooth-carp, Aphanius persicus ana Aphanius sophiae (Pisces, Cyprinodontidae), from Southwest Iran. Tark. Journal Zoology; 31: 69-74.
Hillis, D.M.; Moritz, C.; (1990). Molecular taxonomy. Sinauer Associates Inc Publishers. Sunderland, Massachusetts. U. S. A. 120 p.
Hrbek, T.F.; Keivany, Y.; Coad, B.W.; (2006). New species of Aphanius (Teleostei, Cyprinodontidae) from Isfahan province of Iran and a reanalysis of other species. Copeia; 2: 244-255.
Reichenbacher, B.; Feulner, G.R.; Schulz-Mirbach, T.; (2009). Geographic variation in otolith morphology among freshwater populations of Aphanius dispar (Teleostei, Cyprinodontiformes) from the Southeastern Arabian Peninsula. Journal Morphology; 270: 469-484.
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 329 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 431 |
||