پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 41 |
| تعداد شماره‌ها | 1,150 |
| تعداد مقالات | 9,913 |
| تعداد مشاهده مقاله | 18,451,009 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 12,830,295 |
شناسایی و بررسی جایگاه آرایه‌شناسی اعضای خانواده گورخرماهیان Aphaniidae در حوضه اصفهان و سیرجان با استفاده از ژن میتوکندریایی سیتوکروم اکسیداز I | ||
| فصلنامه علمی زیست شناسی جانوری تجربی | ||
| دوره 11، شماره 2 - شماره پیاپی 42، آذر 1401، صفحه 43-53 اصل مقاله (3.05 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.30473/eab.2023.60987.1850 | ||
| نویسندگان | ||
| آرش جولاده رودبار* 1؛ نگار حسین رحیمی2؛ درسا چراغی2 | ||
| 1دکتری، گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2کارشناس، گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| چکیده | ||
| حوضه اصفهان و سیرجان با دارا بودن 18 گونه ماهی، تنوع نسبتاً مناسبی از ماهیان را در بین حوضههای آبریز محصور ایران دارد. در مطالعات پیشین حضور یک گونه از خانواده گورخرماهیان Aphaniidae در این حوضه به ثبت رسیده بود. اما به‌تازگی گزارشی از حضور گونه Esmaeilius vladykovi براساس شواهد ریخت‌شناسی از این حوضه به ثبت رسیده است که نیاز به بررسی بیش‌تر دارد. به همین منظور با دستگاه الکتروفیشر و ساچوک از محل تیپ E. isfahanensis، E. vladykovi و حوض ماهی (جایی که حضور گونه جدید از آن گزارش شده است) نمونه برداری به عمل آمد. پس از استخراج DNA از نمونهها، ژن COI آن‌ها در دستگاه ترموسایکلر تکثیر و سپس تعیین توالی شد. در ادامه توالی‌های گونه‌های دیگر این خانواده از بانک ژن NCBI دریافت شد. سپس با استفاده از نرم‌افزار IQTREE بهترین مدل تکاملی انتخاب و درخت تبارشناسی ترسیم شد. نتایج حاصل از ترسیم درخت تبارشناسی نشان داد حداقل نُه گونه معتبر از خانواده گورخرماهیان در ایران حضور دارد. علاوه بر این با توجه به قرارگرفتن نمونههای روستای حوض ماهی در خوشه نمونههای صیدشده از محل تیپ گونه E. vladykovi، حضور این گونه در حوضه اصفهان و سیرجان تأیید گردید. هم‌چنین با توجه تمایز ژنتیکی اندک مشاهده‌شده بین جمعیت حوضه مذکور و کارون، احتمال داده شد این گونه توسط مردم محلی به حوضه فوق منتقل شده باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| ایران؛ تنوع ریختی؛ گورخرماهی؛ Aphaniops؛ COI | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Identification and Phylogenetic Status of Members of Aphaniidae Family in the Isfahan and Sirjan Basin Using COI Gene | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Arash Jouladeh Roudbar1؛ Negar Hossein rahimi2؛ Dorsa Cheraghi2 | ||
| 1Ph.D., Department of Fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran | ||
| 2B. A., Department of Fisheries, Faculty of Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Isfahan basin, with 18 species of fish, has a relatively good variety of fish among the Endorheic basins of Iran. In previous studies, the presence of one species of the pupfishes family Aphaniidae was recorded in this basin. However, a recent report of the presence of Esmaeilius vladykovi based on morphological evidence from this basin has been recorded, which needs further investigation. For this purpose, samples of E. isfahanensis, E. vladykovi were obtained from their type localities and Hoz mahi village (where the presence of a new species has been reported) by electro fisher and Hand net. After DNA extraction from the samples, their COI gene was amplified in a thermocycler and then sequenced. Subsequent sequences of other species in this family were obtained from the NCBI Gene Bank. The best evolutionary model and the phylogenetic tree were selected and drawn by IQTREE. The results of the phylogenetic tree showed that at least nine valid species of this family are present in Iran. In addition, due to the location of specimens in the village of Hoz Mahi in the cluster of specimens caught from the type locality of E. vladykovi, the presence of this species in the Isfahan and Sirjan basin was confirmed. Also, due to the few genetic distance observed between the population of Isfahan and Sirjan basin and Karun, it was possible that this species was transferred to mentioned basin by local people. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Aphaniops, COI, Iran, Killifish, Morphological variation | ||
| مراجع | ||
|
Alavi-Yeganeh, M.S.; Keivany, Y.; Seyfabadi, J.; Kazemi, B.; Wallis, G. P. (2014). Taxonomic validity and phylogenetic relationships of a newly-described tooth-carp, Aphanius mesopotamicus Coad, 2009 (Teleostei: Cyprinodontidae). Zootaxa.; 3780: 594-600.
Betancur, R.R.; Wiley, E.O.; Arratia, G.; Acero, A.; Bailly, N.; Miya, M.; Orti, G. (2017). Phylogenetic classification of bony fishes. BMC evolutionary biology; 17: 1-40.
Coad, B. (2009). A new species of tooth-carp, Aphanius mesopotamicus, from Iran and Iraq (Actinopterygii, Cyprinodontidae). Zookeys.;31:149-157.
Coad, B.W. (1998). Systematic biodiversity in the freshwater fishes of Iran. Italian Journal of Zoology.; 65: 101-108.
Coad, B.W. (1980). A re-description of Aphanius ginaonis (Holly, 1929) from southern Iran (Osteichthyes: Cyprinodontiformes). Journal of Natural History; 14: 33-40.
Coad, B.W. (1991). Fishes of the Tigris-Euphrates Basin: a critical checklist. Syllogeus; 68: 1-49.
Coad, B.W. (1995). Freshwater Fishes of Iran. Acta Scientiarum Naturalium Academiae Scientiarum Bohemicae, Brno, 29 (1): 1-64.
Coad, B.W. (2005). Endemicity in the freshwater fishes of Iran. Iranian Journal of Animal Biosystematics, 1 (1): 1-13.
Coad, B.W. (2010). Freshwater fishes of Iraq. Sofia and Moscow Pensoft.; 1-275.
Eschmeyer, W.N.; Fricke, R.; van der Laan, R. (2022). Catalog of Fishes: Genera, Species, References. http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp). Catalog of Fishes electronic version. doi:10.11646/zootaxa.3882.1.1
Freyhof, J.; Yoğurtçuoğlu, B. (2020). A proposal for a new generic structure of the killifish family Aphaniidae, with the description of Aphaniops teimorii (Teleostei: Cyprinodontiformes). Zootaxa.; 4810: 421-451.
Freyhof, J.; Kaya, C.; Ali, A. (2021). Chapter 35: A critical checklist of the inland fishes native to the Euphrates and Tigris Drainages. In: Jawad, L. A. (ed.): Tigris and Euphrates Rivers: their environment from headwaters to mouth, pp. 815-854; Cham (Springer).
Freyhof, J.; Weissenbacher, A.; Geiger, M. (2017). Aphanius kruppi, a new killifish from Oman with comments on the A. dispar species group (Cyprinodontiformes: Aphaniidae). Zootaxa.; 4338: 557-573.
Jouladeh-Roudbar, A.; Ghanavi, H.R.; Doadrio, I. (2020). Ichthyofauna from Iranian freshwater: annotated checklist, diagnosis, taxonomy, distribution and conservation assessment, Zoological Studies.; 59: 0d.
Jouladeh-Roudbar, A.; Vatandoust, S.; Eagderi, S.; Jafari-Kenari, S.; Mousavi-Sabet, H. (2015). Freshwater fishes of Iran.; an updated checklist. AACL Bioflux.; (8): 855-909.
Kumar, S.; Stecher, G.; Tamura, K. (2016). MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular biology and evolution; 33: 1870-1874.
Larkin, M.A.; Blackshields, G.; Brown, N.P.; Chenna, R.; McGettigan, P.A.; McWilliam, H.; Valentin, F.; Wallace, I.M.; Wilm, A.; Lopez, R.; Thompson, J.D. (2007). Clustal W and Clustal X version 2.0. Bioinformatics; 23: 2947-2948.
Miller, SA.; Dykes, D.; Polesky, H. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research.; 16: 1215-1215.
Nelson, J.; Grande, T.; Wilson, M. (2016). Fishes of the World, Fifth Edition.
Rambaut, A. (2009). FigTree v1.5. http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree.
Silvestro, D.; Michalak, I. (2012). RaxmlGUI: a graphical front-end for RAxML. Organisms Diversity & Evolution 12: 335-337.
Teimori, A.; Esmaeili, H.R.; Hamidan, N.; Reichenbacher, B. (2020). Comment on “A proposal for a new generic structure of the killifish family Aphaniidae, with the description of Aphaniops teimorii (Teleostei: Cyprinodontiformes)” by Jörg Freyhof & Baran Yoğurtçuoğlu, Zootaxa (July 2020) 4810 (3): 421-451. FishTaxa.; 17: 15-16.
Ward, R.D.; Zemiak, T.S.; Innes, B.H.; Last, P.R.; Hebert, P.D.N. (2005). DNA barcoding Australia’s fish species. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences.; 360: 1847-1857. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 197 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 202 |
||